Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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PTPRSQ13332 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRSQ13332 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRSQ13332 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRSQ13332 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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PTPRSQ13332 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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PTPRSQ13332 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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PTPRSQ13332 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRSQ13332 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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PTPRSQ13332 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRSQ13332 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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PTPRSQ13332 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
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PTPRSQ13332 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRSQ13332 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRSQ13332 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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PTPRSQ13332 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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PTPRSQ13332 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRSQ13332 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRSQ13332 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRSQ13332 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRSQ13332 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRSQ13332 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRSQ13332 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRSQ13332 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRSQ13332 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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