Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RIGQ13278 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RIGQ13278 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RIGQ13278 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RIGQ13278 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RIGQ13278 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RIGQ13278 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RIGQ13278 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIGQ13278 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIGQ13278 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIGQ13278 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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