Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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SEMA3BQ13214 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3BQ13214 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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