Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CBX3Q13185 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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