Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
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