Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MKRN3Q13064 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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