Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
STRN3Q13033 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
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