Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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