Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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FOXF1Q12946 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXF1Q12946 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF1Q12946 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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