Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFSWAPQ12872 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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