Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms