Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CPSF1Q10570 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
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