Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms