Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCBP1Q09161 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCBP1Q09161 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms