Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms