Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CKAP4Q07065 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms