Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCZQ05513 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms