Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ID3Q02535 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ID3Q02535 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ID3Q02535 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ID3Q02535 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ID3Q02535 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ID3Q02535 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ID3Q02535 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ID3Q02535 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ID3Q02535 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ID3Q02535 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ID3Q02535 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ID3Q02535 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ID3Q02535 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ID3Q02535 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ID3Q02535 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ID3Q02535 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ID3Q02535 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ID3Q02535 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ID3Q02535 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ID3Q02535 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ID3Q02535 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ID3Q02535 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ID3Q02535 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ID3Q02535 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ID3Q02535 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ID3Q02535 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ID3Q02535 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ID3Q02535 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ID3Q02535 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ID3Q02535 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ID3Q02535 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ID3Q02535 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ID3Q02535 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ID3Q02535 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ID3Q02535 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ID3Q02535 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ID3Q02535 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ID3Q02535 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ID3Q02535 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms