Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG1Q02413 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms