Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms