Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK17Q00537 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK17Q00537 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK17Q00537 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK17Q00537 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK17Q00537 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK17Q00537 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK17Q00537 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK17Q00537 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK17Q00537 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK17Q00537 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK17Q00537 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK17Q00537 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK17Q00537 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK17Q00537 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK17Q00537 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK17Q00537 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK17Q00537 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDK17Q00537 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDK17Q00537 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK17Q00537 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK17Q00537 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK17Q00537 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDK17Q00537 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK17Q00537 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK17Q00537 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK17Q00537 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK17Q00537 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK17Q00537 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK17Q00537 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK17Q00537 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK17Q00537 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK17Q00537 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK17Q00537 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK17Q00537 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK17Q00537 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK17Q00537 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK17Q00537 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK17Q00537 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK17Q00537 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK17Q00537 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK17Q00537 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK17Q00537 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK17Q00537 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK17Q00537 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK17Q00537 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK17Q00537 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK17Q00537 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK17Q00537 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK17Q00537 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK17Q00537 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK17Q00537 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK17Q00537 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK17Q00537 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK17Q00537 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK17Q00537 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK17Q00537 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDK17Q00537 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDK17Q00537 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK17Q00537 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK17Q00537 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK17Q00537 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK17Q00537 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK17Q00537 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK17Q00537 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK17Q00537 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK17Q00537 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms