Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PITPNAQ00169 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITPNAQ00169 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms