Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNA1P78396 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms