Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM193AP78312 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM193AP78312 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM193AP78312 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM193AP78312 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM193AP78312 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM193AP78312 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM193AP78312 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM193AP78312 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM193AP78312 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM193AP78312 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM193AP78312 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM193AP78312 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM193AP78312 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM193AP78312 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM193AP78312 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM193AP78312 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM193AP78312 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM193AP78312 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM193AP78312 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM193AP78312 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM193AP78312 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM193AP78312 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM193AP78312 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM193AP78312 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM193AP78312 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM193AP78312 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM193AP78312 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM193AP78312 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM193AP78312 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM193AP78312 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM193AP78312 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM193AP78312 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM193AP78312 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM193AP78312 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM193AP78312 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM193AP78312 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM193AP78312 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM193AP78312 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAM193AP78312 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM193AP78312 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM193AP78312 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM193AP78312 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM193AP78312 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM193AP78312 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM193AP78312 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM193AP78312 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM193AP78312 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms