Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-24P63145 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-24P63145 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-24P63145 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-24P63145 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-24P63145 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVK-24P63145 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVK-24P63145 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVK-24P63145 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-24P63145 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms