Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms