Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCS1P62166 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCS1P62166 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NCS1P62166 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCS1P62166 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCS1P62166 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCS1P62166 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCS1P62166 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCS1P62166 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCS1P62166 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCS1P62166 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCS1P62166 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCS1P62166 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCS1P62166 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCS1P62166 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NCS1P62166 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCS1P62166 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NCS1P62166 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NCS1P62166 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCS1P62166 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCS1P62166 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCS1P62166 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCS1P62166 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NCS1P62166 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCS1P62166 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCS1P62166 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCS1P62166 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCS1P62166 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCS1P62166 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCS1P62166 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCS1P62166 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCS1P62166 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCS1P62166 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCS1P62166 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCS1P62166 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCS1P62166 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCS1P62166 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCS1P62166 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCS1P62166 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCS1P62166 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCS1P62166 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCS1P62166 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCS1P62166 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCS1P62166 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCS1P62166 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCS1P62166 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCS1P62166 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCS1P62166 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NCS1P62166 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCS1P62166 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCS1P62166 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCS1P62166 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCS1P62166 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCS1P62166 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCS1P62166 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCS1P62166 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCS1P62166 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCS1P62166 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCS1P62166 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCS1P62166 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCS1P62166 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCS1P62166 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCS1P62166 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCS1P62166 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCS1P62166 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCS1P62166 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCS1P62166 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCS1P62166 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCS1P62166 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCS1P62166 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCS1P62166 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCS1P62166 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCS1P62166 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCS1P62166 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCS1P62166 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCS1P62166 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCS1P62166 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCS1P62166 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCS1P62166 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCS1P62166 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCS1P62166 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCS1P62166 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms