Protein–RNA interactions for Protein: P61962

DCAF7, DDB1- and CUL4-associated factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF7P61962 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF7P61962 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF7P61962 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms