Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2MP61081 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms