Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTBP60709 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ACTBP60709 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ACTBP60709 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ACTBP60709 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTBP60709 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTBP60709 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms