Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB25P57735 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB25P57735 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB25P57735 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB25P57735 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB25P57735 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB25P57735 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB25P57735 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB25P57735 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB25P57735 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB25P57735 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB25P57735 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB25P57735 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB25P57735 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB25P57735 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB25P57735 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB25P57735 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB25P57735 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB25P57735 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB25P57735 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB25P57735 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB25P57735 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB25P57735 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB25P57735 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB25P57735 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB25P57735 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB25P57735 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB25P57735 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB25P57735 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB25P57735 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB25P57735 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB25P57735 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB25P57735 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB25P57735 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB25P57735 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB25P57735 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB25P57735 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB25P57735 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB25P57735 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB25P57735 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB25P57735 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB25P57735 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB25P57735 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB25P57735 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB25P57735 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB25P57735 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB25P57735 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB25P57735 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB25P57735 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB25P57735 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB25P57735 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB25P57735 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB25P57735 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB25P57735 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB25P57735 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB25P57735 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB25P57735 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB25P57735 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB25P57735 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB25P57735 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB25P57735 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB25P57735 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB25P57735 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB25P57735 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB25P57735 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB25P57735 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB25P57735 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB25P57735 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms