Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTBP2P56545 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms