Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1P56182 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1P56182 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1P56182 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1P56182 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1P56182 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1P56182 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1P56182 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1P56182 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1P56182 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1P56182 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1P56182 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1P56182 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1P56182 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1P56182 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1P56182 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1P56182 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP1P56182 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP1P56182 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP1P56182 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP1P56182 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP1P56182 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP1P56182 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP1P56182 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP1P56182 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP1P56182 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP1P56182 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP1P56182 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP1P56182 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP1P56182 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP1P56182 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP1P56182 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP1P56182 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP1P56182 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1P56182 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1P56182 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1P56182 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1P56182 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1P56182 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1P56182 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1P56182 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1P56182 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1P56182 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1P56182 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1P56182 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1P56182 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1P56182 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1P56182 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1P56182 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1P56182 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP1P56182 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP1P56182 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP1P56182 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP1P56182 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP1P56182 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP1P56182 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP1P56182 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP1P56182 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP1P56182 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP1P56182 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP1P56182 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP1P56182 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP1P56182 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP1P56182 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP1P56182 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP1P56182 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP1P56182 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP1P56182 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP1P56182 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP1P56182 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP1P56182 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP1P56182 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP1P56182 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP1P56182 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP1P56182 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP1P56182 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP1P56182 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP1P56182 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP1P56182 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP1P56182 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP1P56182 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP1P56182 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP1P56182 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP1P56182 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RRP1P56182 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RRP1P56182 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RRP1P56182 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RRP1P56182 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RRP1P56182 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RRP1P56182 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP1P56182 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP1P56182 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP1P56182 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP1P56182 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP1P56182 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP1P56182 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP1P56182 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP1P56182 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP1P56182 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP1P56182 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms