Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLR2KP53803 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLR2KP53803 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLR2KP53803 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLR2KP53803 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLR2KP53803 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLR2KP53803 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLR2KP53803 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLR2KP53803 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLR2KP53803 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLR2KP53803 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLR2KP53803 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLR2KP53803 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLR2KP53803 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLR2KP53803 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
POLR2KP53803 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
POLR2KP53803 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms