Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP2S1P53680 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms