Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP1P53367 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms