Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCR4P51679 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCR4P51679 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCR4P51679 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCR4P51679 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCR4P51679 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCR4P51679 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCR4P51679 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCR4P51679 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCR4P51679 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCR4P51679 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCR4P51679 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCR4P51679 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCR4P51679 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCR4P51679 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCR4P51679 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCR4P51679 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCR4P51679 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCR4P51679 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCR4P51679 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCR4P51679 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCR4P51679 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCR4P51679 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCR4P51679 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCR4P51679 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCR4P51679 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCR4P51679 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCR4P51679 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCR4P51679 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCR4P51679 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCR4P51679 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCR4P51679 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCR4P51679 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCR4P51679 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCR4P51679 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCR4P51679 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCR4P51679 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCR4P51679 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCR4P51679 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCR4P51679 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCR4P51679 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCR4P51679 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms