Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
IDH3AP50213 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IDH3AP50213 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms