Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A3P48751 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A3P48751 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A3P48751 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A3P48751 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A3P48751 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A3P48751 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms