Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD4P46934 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms