Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms