Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COPB2P35606 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPB2P35606 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPB2P35606 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPB2P35606 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COPB2P35606 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPB2P35606 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COPB2P35606 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPB2P35606 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPB2P35606 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COPB2P35606 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPB2P35606 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPB2P35606 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COPB2P35606 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPB2P35606 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COPB2P35606 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPB2P35606 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPB2P35606 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPB2P35606 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPB2P35606 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPB2P35606 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPB2P35606 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPB2P35606 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPB2P35606 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COPB2P35606 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPB2P35606 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPB2P35606 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPB2P35606 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPB2P35606 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COPB2P35606 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPB2P35606 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPB2P35606 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPB2P35606 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPB2P35606 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPB2P35606 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPB2P35606 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COPB2P35606 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPB2P35606 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPB2P35606 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPB2P35606 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPB2P35606 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPB2P35606 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPB2P35606 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPB2P35606 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPB2P35606 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COPB2P35606 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPB2P35606 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPB2P35606 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COPB2P35606 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPB2P35606 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COPB2P35606 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPB2P35606 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPB2P35606 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPB2P35606 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPB2P35606 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPB2P35606 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPB2P35606 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPB2P35606 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPB2P35606 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPB2P35606 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPB2P35606 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPB2P35606 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPB2P35606 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPB2P35606 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPB2P35606 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COPB2P35606 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPB2P35606 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPB2P35606 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPB2P35606 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPB2P35606 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPB2P35606 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPB2P35606 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPB2P35606 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPB2P35606 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPB2P35606 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPB2P35606 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPB2P35606 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPB2P35606 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPB2P35606 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPB2P35606 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPB2P35606 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPB2P35606 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPB2P35606 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPB2P35606 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COPB2P35606 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPB2P35606 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPB2P35606 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPB2P35606 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPB2P35606 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPB2P35606 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPB2P35606 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPB2P35606 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPB2P35606 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COPB2P35606 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPB2P35606 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPB2P35606 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPB2P35606 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPB2P35606 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPB2P35606 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPB2P35606 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms