Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM5P33992 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM5P33992 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM5P33992 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM5P33992 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM5P33992 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM5P33992 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM5P33992 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM5P33992 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM5P33992 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM5P33992 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM5P33992 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM5P33992 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM5P33992 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM5P33992 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM5P33992 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM5P33992 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM5P33992 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM5P33992 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM5P33992 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM5P33992 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM5P33992 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM5P33992 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM5P33992 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM5P33992 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM5P33992 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM5P33992 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM5P33992 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM5P33992 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM5P33992 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM5P33992 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM5P33992 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM5P33992 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM5P33992 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM5P33992 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM5P33992 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM5P33992 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM5P33992 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM5P33992 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM5P33992 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM5P33992 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM5P33992 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM5P33992 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM5P33992 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM5P33992 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM5P33992 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM5P33992 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM5P33992 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM5P33992 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM5P33992 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM5P33992 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM5P33992 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM5P33992 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM5P33992 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM5P33992 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM5P33992 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCM5P33992 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCM5P33992 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCM5P33992 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM5P33992 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM5P33992 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM5P33992 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM5P33992 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM5P33992 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM5P33992 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM5P33992 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM5P33992 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM5P33992 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM5P33992 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM5P33992 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM5P33992 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM5P33992 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM5P33992 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM5P33992 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM5P33992 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM5P33992 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM5P33992 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM5P33992 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM5P33992 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM5P33992 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM5P33992 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM5P33992 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM5P33992 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM5P33992 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM5P33992 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM5P33992 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM5P33992 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM5P33992 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM5P33992 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM5P33992 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM5P33992 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM5P33992 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM5P33992 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM5P33992 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM5P33992 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM5P33992 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM5P33992 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM5P33992 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM5P33992 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM5P33992 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms