Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
HOXC13P31276 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC13P31276 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms