Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC12P31275 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms