Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC8P31273 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms