Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXA10P31260 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms