Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms