Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GCAP28676 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GCAP28676 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GCAP28676 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GCAP28676 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GCAP28676 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GCAP28676 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GCAP28676 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GCAP28676 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GCAP28676 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GCAP28676 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GCAP28676 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GCAP28676 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GCAP28676 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GCAP28676 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GCAP28676 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GCAP28676 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GCAP28676 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GCAP28676 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GCAP28676 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GCAP28676 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GCAP28676 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GCAP28676 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GCAP28676 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GCAP28676 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCAP28676 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCAP28676 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCAP28676 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCAP28676 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCAP28676 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GCAP28676 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCAP28676 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCAP28676 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCAP28676 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCAP28676 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCAP28676 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCAP28676 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCAP28676 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCAP28676 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms