Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXP28300 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXP28300 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXP28300 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXP28300 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXP28300 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXP28300 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXP28300 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXP28300 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXP28300 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXP28300 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXP28300 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXP28300 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXP28300 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXP28300 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXP28300 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXP28300 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXP28300 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXP28300 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXP28300 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXP28300 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXP28300 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXP28300 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXP28300 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXP28300 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXP28300 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXP28300 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXP28300 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXP28300 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXP28300 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXP28300 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXP28300 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXP28300 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXP28300 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXP28300 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXP28300 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXP28300 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXP28300 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXP28300 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXP28300 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXP28300 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXP28300 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXP28300 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXP28300 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXP28300 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LOXP28300 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LOXP28300 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LOXP28300 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
LOXP28300 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXP28300 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXP28300 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXP28300 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXP28300 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXP28300 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXP28300 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXP28300 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXP28300 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXP28300 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXP28300 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXP28300 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXP28300 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXP28300 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXP28300 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXP28300 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXP28300 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXP28300 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXP28300 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXP28300 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXP28300 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXP28300 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXP28300 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXP28300 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms